تعاني وزارة النفط (الإدارة المركزية) من مشكلة كبيرة يجب تداركها وهي: عدم مساواتهم بالعاملين الإداريين في الشركات من حيث الحوافز والتعويضات، ولهذه المشكلة آثار خطيرة منها:

1- إفراغ الوزارة من الكفاءات التي تهرب أو تحاول الهروب إلى الشركات.
2- تململ وعدم رضى العاملين في الوزارة ما ينعكس سلباً على أداء العمل.
نرجو إيجاد حل لهذه المشكلة وخاصة أن الوزارة لها دور كبير في الإدارة والإشراف على عمل كل المؤسسات والشركات التابعة لها وإن إيجاد نظام حوافز وتعويضات جيد سيؤدي إلى الحفاظ على الكفاءات وتنشيط العمل ما ينعكس إيجاباً على كل قطاع النفط والثروة المعدنية في سورية..